電腦會計系統最重要之考慮因素之一是其資料之可靠性。當電腦會計系統之使用上軌道後，用戶便每天積累數據。此等數據往往成爲公司重要資產之一。因此，爲預防不如意之意外事件，例如硬盤損壞、網絡錯誤，不良員工蓄意破壞等，用戶應時常做好後備工作。

後備磁碟可分爲兩大類：

 每天後備                    

每天後備爲每天皆執行之後備工作。縱橫建議用戶依循以下程序

=> 準備六套磁碟 (若星期日亦爲工作日，則準備七套)

=> 將磁碟清楚記上“星期一＂，“星期二＂等記號。星期一則將資料後備至“星期一＂之磁碟，星期二則將資料後備至“星期二＂之磁碟。

=> 若不幸地某天數據出現問題而需要做重取，則取出上一天之後備磁碟以作重取之用。舉例說，若星期五數據出現問題需要重取資料，則取出星期四之後備磁碟作重取之用。那麼一天之數據便失去。若不幸地星期四之後備磁碟亦損壞，則取出星期三之後備磁碟作重取之用。那麼二天之數據便失去。

用戶可用六套磁碟作後備之用。每套碟碟數目要視乎資料的多少。星期一將資料後備至星期一的磁碟；星期二將資料後備至星期二的磁碟；等等。

以上方案之好處是用戶每天只做一份後備。而且，因每套磁碟每週只使用一次，磁碟損壞的機會便大幅減低。

 舊數據後備                  

舊數據後備之作用在於保障電腦或網絡在執行不可恢復的程序時出現錯誤，例如真實過帳及清除舊帳單。若這些程序執行後用戶發現數據出現錯誤，用戶亦可重取後備資料。